清軍的火槍戰(zhàn)術(shù)主要是“連環(huán)本柵”。據(jù)清實錄和起居注記載，具體操作流程是這樣的：在作戰(zhàn)時，每兩名身穿棉甲的鹿角兵為一組，負責抬鹿角木至于軍陣前。鹿角木后站一執(zhí)小紅旗的“領(lǐng)催”，火槍手在鹿角木后列隊，排成九行，每行一隊，每一隊間隔十步距離。號角手吹螺號三次，炮兵發(fā)炮三次。火炮炮轟完畢，第一隊火槍兵上前，齊射一次。其他各隊依次向前進十步。第一隊射擊完畢，全隊右轉(zhuǎn)彎齊步走，在隊尾重新排列裝填。第二隊上前繼續(xù)射擊。如此反復(fù)十次為一個連環(huán)。

1690年，清軍完成戰(zhàn)前部署，和準噶爾軍在薩利克河展開火槍對射。準噶爾人依托地勢，將駱駝集中起來，面向敵人排成橫隊，掩護士兵開槍。

此種陣法叫做駝城戰(zhàn)術(shù)，是奧斯曼帝國的原創(chuàng)，后來經(jīng)過莫臥兒帝國改進，火力及其強大。如今，在烏蘭布通，準噶爾也希望以此給予清軍重擊。

但是，清軍經(jīng)過一段時間的射擊后，沒有過河。火槍兵射擊完畢后后撤，露出了大批炮兵部隊。清軍立即展開大規(guī)模炮擊，準噶爾的陣型被打亂，損失慘重。炮擊持續(xù)到傍晚，福全部立即命令火器營分成左右兩翼發(fā)動進攻。

但是左翼軍團攻擊并不順利，由于地形吃虧，準噶爾利用火槍居高臨下向清軍射擊，并且出動騎兵部隊參戰(zhàn)，清軍攻擊倉促，逐漸不支而撤退。而右翼軍團早已強渡過河，但是立即陷入河灘沼澤，進退兩難。準噶爾軍趁機向清軍列隊射擊，清軍傷亡很大。戰(zhàn)斗中，鑲白旗將領(lǐng)格斯泰沖入敵營，左右沖殺直到陣亡。清軍戰(zhàn)斗到了日暮時分，傷亡過大，不得不退到河流南岸。

準噶爾雖然給予清軍很大殺傷，但是自身傷亡更為慘重。特別是車馬駱駝在清軍炮擊下盡數(shù)毀壞。清軍此時希望利用火炮和補給優(yōu)勢拖死噶爾丹。但是噶爾丹此時正準備組織撤退。

噶爾丹假意求和，暗自組織軍隊撤離。福全害怕再受埋伏沒有貿(mào)然進攻。但是當晚看到噶爾丹部全速撤離，向錫林浩特撤去。才下令全軍追擊，但是沒有趕上。常寧部也在烏珠穆沁撲空，被迫折返烏蘭布通。兩隊清軍會師后班師回朝。

烏蘭布通一戰(zhàn)宣告結(jié)束，作戰(zhàn)雙方死傷慘重，但是康熙皇帝不得不向海外宣告大捷。漠北喀爾喀見到清朝強大的力量，再次投向清朝。

1691年五月，清朝政府、喀爾喀蒙古、漠南蒙古在四道河畔多倫諾爾舉行會盟?？柨γ晒疟硎咀袷厍宄?，喀爾喀部的矛盾也得以化解。清朝授予喀爾喀蒙古王公親王、貝勒、郡王位，并且推廣盟旗制度。但是喀爾喀蒙古的札薩克可以世襲，漠南蒙古的不能世襲。于是，喀爾喀蒙古又稱“外藩蒙古”，漠南蒙古也稱“內(nèi)屬蒙古”。這也就是外蒙古和內(nèi)蒙古的由來。

烏蘭木通之戰(zhàn)以后，準噶爾軍在撤退途中爆發(fā)大規(guī)模瘟疫，準噶爾部減員大半。1691年，噶爾丹退回科布多，兵力只剩幾千人。

當時，阿拉善地區(qū)的部分準噶爾和和碩特蒙古部落還順從噶爾丹。西藏也把部分糧食運到了阿拉善，再經(jīng)阿拉善運抵科布多。并且，在西藏教廷的主持下，噶爾丹暫時緩解了他和阿拉布坦之間的矛盾，約定噶爾丹不許再回準噶爾本部。在穩(wěn)定了局面以后，噶爾丹重整旗鼓，開始在科布多屯田。表面上，噶爾丹向康熙認錯，但是實際上一場大戰(zhàn)再所難免。

1691年到1695年，清朝令外蒙古三部暫時不要回遷故地，滯留漠南。與此同時，加強了后勤、駐軍和無期配置的建設(shè)。并且在內(nèi)蒙古開辟了五條官道。1691年，康熙帝在滿洲八旗軍中建立火器營，配備大量火槍和子母炮。并且，改革了以前的火槍戰(zhàn)術(shù)，將槍隊和炮隊合為一體，加強了滿人和漢人槍隊的配合。并且，改進了傳令方式，以鼓聲計算步數(shù)，以鑼聲為開槍信號。射擊完畢后，又添加了騎兵沖殺環(huán)節(jié)。

1695年，噶爾丹再次入侵外蒙古，并且對外宣稱自己聘請了六萬俄國火槍兵。還四處前往外蒙古各地搞串聯(lián)策反。清廷首先派出科爾沁親王秘密出使噶爾丹部，引誘噶爾丹深入。然后排查外蒙古各大喇嘛廟，抓捕噶爾丹間諜。

1695年，康熙帝再次御駕親征，出擊噶爾丹。

東路軍由黑龍江將軍薩布素率領(lǐng)，共六千人，越過大興安嶺堵截噶爾丹東侵部隊。

中路軍由康熙帝率領(lǐng)，總兵力4萬。統(tǒng)帥京師禁軍、火器營、炮兵、蒙古兵、綠營兵、盛京兵、內(nèi)蒙古各盟部隊，壓向克魯倫河。

西路軍由費揚古、孫思克率領(lǐng)，領(lǐng)兵10000人，出寧夏北上。

三軍加上后勤人員，大約十萬人。

此次遠征漠北，后勤規(guī)模十分龐大。一共七千余輛大車、30萬匹馬匹參加運輸和作戰(zhàn)。內(nèi)陸商家也被允許承運軍事物資。

1696年，清軍開拔。中路軍進展順利，勢如破竹。西路軍由于遭遇大雪，損失嚴重。又加上準噶爾部襲擊，不得不改變道路?？滴醯蹫榇烁淖儾呗?，放緩行軍步伐。1696年五月，各軍抵達克魯倫河。

但是，當?shù)诌_噶爾丹駐地時候，噶爾丹又一次逃竄。西路軍在改道到達昭莫多后，人困馬乏，疲軟不堪。噶爾丹為避開中路軍打擊西路軍，立即和清軍中路脫離接觸。1696年五月十三，中路軍抵達托諾山，但是噶爾丹又一次逃走，中路軍糧草用盡，康熙帝命令暫行后撤，等待于成龍押運的糧草前來。

此時，西路軍和噶爾丹在昭莫多遭遇，展開激戰(zhàn)。噶爾丹先發(fā)制人，命令騎兵上前沖擊，兩翼噶爾丹部隊不斷放槍射擊。西路軍立即部署，滿洲正白旗碩岱、正黃旗阿南達首先率領(lǐng)八旗騎兵和噶爾丹交鋒，并且邊打邊走，向西部山區(qū)移動，將噶爾丹部引入圈套。

清軍在山區(qū)部署了子母炮，這個子母炮的前身就是佛郎機炮。經(jīng)過湯若望改造，炮身改用熟鐵打造，縮小了口徑，雖然威力變小，但是射程和初速大大增加。康熙年間的火器專家戴梓也參與過改進工作。噶爾丹騎兵向高處的清軍發(fā)動突擊，清軍開始列陣開槍放炮，噶爾丹部損失慘重。噶爾丹見狀立即命令騎兵改步兵繼續(xù)進攻。清軍此時也命令藤甲軍出戰(zhàn)，雙方打作一團，難分勝負。

費揚古此時趁勢包抄了噶爾丹的后路，噶爾丹腹背受敵，清軍和噶爾丹軍四處交戰(zhàn)，戰(zhàn)局發(fā)展到白熱化。

清軍不斷開槍射擊，完全不顧廝打在一起的友軍部隊，噶爾丹部大片士兵倒下，噶爾丹妻子阿努可敦被清軍擊斃。終于，噶爾丹力戰(zhàn)不支，撤出戰(zhàn)場。昭莫多之戰(zhàn)告終。

此次會戰(zhàn)，噶爾丹損失兩千余人，大批物資為清軍繳獲。五月十八，中路軍和西路軍回合西進，康熙帝接到戰(zhàn)報后大喜過望，宣布班師回朝。

1696年六月，清軍返回。二征噶爾丹結(jié)束。

噶爾丹逃跑后，手里僅僅剩下不到五千人。此時，準噶爾已被阿拉布坦占據(jù)，噶爾丹無法回到準噶爾。往北退往俄羅斯的道路被明安特、鐵良古特等部落阻隔。往南的吐魯番和哈密一帶的政權(quán)投靠清朝，青海和碩特和阿拉善衛(wèi)拉特蒙古也臣服在清朝之下。噶爾丹四面受困，惶惶不可終日。

于是，噶爾丹不得不遠走西藏。此時西藏由第巴桑結(jié)嘉措掌權(quán)。但是出逃計劃被清軍得知，并且清朝還得知了達賴五世去世的消息。1696年九月，康熙帝命人前往西藏面見桑杰加措。

桑杰加措看到康熙帝的詔書十分恐慌。因為康熙帝在詔書中嚴厲警告西藏地方不準收留噶爾丹，否則就要派兵進入西藏。桑杰加措不得不斷絕了和噶爾丹的聯(lián)系。噶爾丹走投無路，部下不斷投誠清軍。

昭莫多大戰(zhàn)之后，喀爾喀三部回到外蒙，車臣汗將達里岡愛草原獻給清廷作為皇家牧場，直到1912年才被外蒙古收回。清朝開始在外蒙古駐扎軍隊，囤積物資，擇機徹底消滅噶爾丹。噶爾丹一度襲擊清軍祖良碧部糧草，被清軍擊潰。噶爾丹缺槍少彈、缺糧少藥，不得不以打獵為生。清軍派出小股部隊截殺打獵的噶爾丹部隊。

康熙帝得知了噶爾丹窘境，準備發(fā)動對噶爾丹的最后一擊。1697年，噶爾丹部投降清朝的將領(lǐng)曼齊、阿旺丹津在科布多找到了噶爾丹所部，向噶爾丹勸降。噶爾丹不為所動，驅(qū)逐了他們。

1697年二月，康熙帝抵達寧夏，著手消滅噶爾丹。噶爾丹此時已經(jīng)病重。但是就是這樣他也拒絕投降，并且招致了手下的不滿。截止2月底，噶爾丹部只剩下兩名軍官還隨從，噶爾丹末日將近。

1697年三月，清軍北上出擊。此時，噶爾丹早已病死，其部下將其尸體火化后，率殘部投降清朝。但是，噶爾丹骨灰被阿拉布坦截留。

清朝為了奪回骨灰，自1697年開始，多次派人索要。直到1698年準噶爾才歸還骨灰。康熙帝下令將噶爾丹骨灰懸掛示眾。

對噶爾丹子女，康熙帝準許其在中原落地生根。噶爾丹部被劃入察哈爾牛錄和安置于外蒙古管理。

至此，噶爾丹勢力徹底覆滅。清朝和噶爾丹的歷次作戰(zhàn)中，雖損失慘重，但是也把外蒙古劃入清朝版圖，同時，阿拉善、土爾扈特、額濟納部也并入清朝統(tǒng)治，哈密和吐魯番也成為清朝領(lǐng)土，清朝勢力進入新疆一帶。此外，清朝也趁機通過封王賜爵，將青海納入領(lǐng)土之中。

準噶爾勢力受到沉重打擊，一度不敢進犯清朝，直到1718年，在西藏地區(qū)，清準又展開了爭斗。而這次戰(zhàn)役后，西藏也成為了中國領(lǐng)土的一部分……