酸菜老師曾經(jīng)推薦零基礎(chǔ)的學(xué)員們把miRNA作為科研入門的引線，因?yàn)閙iRNA的機(jī)制簡(jiǎn)單，作為一個(gè)單變量的研究主題還是很適合的，一兩分的SCI也可以，三五分的文章也不少，機(jī)制做得好，上10分也不是沒(méi)有可能。

工欲善其事必先利其器，解螺旋的課程里也提到過(guò)很多miRNA數(shù)據(jù)庫(kù)，例如TargetScan和StarBase。今天再給大家介紹一款研究miRNA的終極核武器——mirDIP（網(wǎng)址：http://ophid./mirDIP/index.jsp ）。

這款工具的搜索功能相當(dāng)強(qiáng)大，而且整合了多達(dá)到30個(gè)miRNA數(shù)據(jù)庫(kù)資源的信息！筆者表示看到時(shí)很震驚。

其功能模塊主要有3塊：

1. Unidirectional search：這部分為自由搜索靶向基因的miRNA和miRNA靶向的基因；

2. Bidirectional search：這部分需同時(shí)提供基因和miRNA，預(yù)測(cè)輸入的兩者間是否有關(guān)系；

3. miRNA-gene matrix：這部分需提供多個(gè)基因（或miRNA），預(yù)測(cè)出能同時(shí)與多個(gè)基因（或miRNA）作用的miRNA（或基因）。

1.Unidirectional search

搜索框介紹

結(jié)果框介紹

2.Bidirectional search

在本例中，我們點(diǎn)擊Example search，看看搜索結(jié)果：

首先網(wǎng)站會(huì)提醒你，你輸入的基因名或者miRNA存在格式不規(guī)范的問(wèn)題：

在結(jié)果欄，我們可以看到APP這個(gè)基因與hsa-miR-17-5p的靶向關(guān)系在多個(gè)來(lái)源的數(shù)據(jù)中得到驗(yàn)證，那么能夠在實(shí)驗(yàn)中得到驗(yàn)證的可能性也就更大。

3.miRNA-gene matrix

這部分分為Search gene symbol和Search miRNA兩個(gè)模塊，兩部分的使用方法一樣，我們以Search gene symbol為例。

這部分的功能為“Search miRNAs targeting a group of genes.”，可以找到一些能同時(shí)靶向一些重要基因的miRNA，如此這個(gè)查詢到的miRNA的重要性就不言而喻了。

數(shù)據(jù)庫(kù)的介紹就到這里，學(xué)習(xí)更多關(guān)于miRNA研究套路，歡迎加入解螺旋的課程！