責(zé)編丨迦溆

白血病（Leukemia）也稱為“血癌”，是一類起源于造血干細胞的惡性腫瘤。從基因?qū)用嫔蟻碚f，白血病的發(fā)生發(fā)展與基因的改變密切相關(guān)。在正常生理過程中，每個人的DNA復(fù)制都受到非常精密的調(diào)控，嚴格遵守中心法則，并且還有多種輔助機制對復(fù)制中產(chǎn)生的突變進行檢查和修復(fù)。但在腫瘤形成過程中，細胞的基因組復(fù)制常會引入一定的變異，比如單堿基突變，融合基因等。這些染色體結(jié)構(gòu)變異或者基因突變不僅是白血病分型的重要依據(jù)，還是影響白血病治療和預(yù)后的重要因素。

近日，由上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院附屬瑞金醫(yī)院，醫(yī)學(xué)基因組學(xué)國家重點實驗室，上海血液學(xué)研究所，國家轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)中心（上海）牽頭，聯(lián)合上海兒童醫(yī)學(xué)中心、美國圣述德兒童醫(yī)學(xué)研究院、瑞典隆德大學(xué)、日本東京大學(xué)、新加坡國立大學(xué)等10余家國際著名科研院所和醫(yī)院，采用轉(zhuǎn)錄組學(xué)大數(shù)據(jù)驅(qū)動策略，開展急性淋巴白血病的國際多中心轉(zhuǎn)錄組學(xué)數(shù)據(jù)分析，報道了1,223例B-ALL病例的轉(zhuǎn)錄組全景圖譜（圖1），如融合基因、基因突變和異常基因表達通路（圖2）。該工作近日以Transcriptional landscape of B cell precursor acute lymphoblastic leukemia based on an international study of 1,223 cases為題發(fā)表在PNAS雜志上。

該研究共定義了十四個B-ALL基因表達亞組（G1-G14）。其中八個亞組（G1-G8）與之前的文獻報道完全一致（MEF2D基因融合亞組，TCF3-PBX1基因融合亞組，ETV6-RUNX1基因融合/ ETV6-RUNX1-like亞組，DUX4 基因融合亞組，ZNF384基因融合亞組，BCR-ABL1 融合/ Ph-like亞組，高二倍體核型亞組，和 KMT2A融合亞組），同時新定義了六個額外的基因表達亞組：G9與PAX5和CRLF2基因融合相關(guān)；G10和G11分別普遍存在PAX5（p.P80R）和IKZF1（p.N159Y）基因突變；G12與IGH-CEBPE基因融合和ZEB2（p.H1038R）基因突變；G13和G14分別富集TCF3/4-HLF和NUTM1融合。

預(yù)后分析結(jié)果顯示，在兒童B-ALL中，G2-G5以及G7（51至65/67染色體）亞組較為低危險度，G7（≤50個染色體）和G9為中危險度，而G1，G6和G8為高危險度亞組。在成人B-ALL中，G1，G2，G6和G8與高危險度相關(guān)，而G4，G5和G7的相對較好。該項研究所納入的數(shù)據(jù)集全面地揭示了B-ALL的基因表達亞組，這些基因表達亞組具有非常明顯的基因融合、基因突變和異?；?通路表達等分子異常特征。同時，該項研究成果為B-ALL疾病分型、預(yù)后分層的優(yōu)化，以及疾病的精準醫(yī)療提供重要支持，同時，也強烈建議引入RNA測序作為ALL的常規(guī)臨床診斷手段之一。

據(jù)悉，瑞金醫(yī)院黃金艷研究員、陳賽娟研究員、瑞典隆德大學(xué)Thoas Fioretos教授、美國圣述德兒童醫(yī)學(xué)研究院Ching-Hon Pui教授為共同通訊作者，上海交大碩士研究生李劍峰、博士研究生代雨婷和瑞典隆德大學(xué)副研究員Henrik Lilljebj?rn為共同第一作者。該工作獲得了上海交通大學(xué)高性能計算中心的大力支持，所有計算均在上海交大的π超算上完成。

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https://www./content/115/50/E11711