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第五周第2節(jié)

 王博士的御書房 2018-10-02
通過篩選后獲得的報告結(jié)果要用生信技術(shù)來分析,具體不詳。。。
生信技術(shù)分析分兩步:原始數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換成差異基因列表,整合分析。

一些牛逼的雜志在錄用文章時要求作者上傳高通量數(shù)據(jù)用以幫助沒錢的人,因此從別人的高通量數(shù)據(jù)里面挖掘差異分子也是可行的。一般最好的是NCBI的GEO數(shù)據(jù)庫,挖一個差異出來用。

腫瘤的數(shù)據(jù)庫是最全面的,一個可用的數(shù)據(jù)庫索引網(wǎng)站叫omictools

從數(shù)據(jù)庫里面猜一批分子出來,主要是看那些差異很明顯的分子,需要拿到差異分子列表,然后通過閱讀文獻(xiàn)和綜述把有缺陷的分子排除掉,最后剩下兩三個分子一起做實(shí)驗(yàn),分子細(xì)胞動物實(shí)驗(yàn)去做,還可以做預(yù)實(shí)驗(yàn)來驗(yàn)證一下分子出現(xiàn)表型的可行性。分子做實(shí)驗(yàn)要一批一批做,一起做實(shí)驗(yàn)避免把寶壓在一個分子上。

沒得測序也沒得數(shù)據(jù)庫的窮鬼就從文獻(xiàn)里面找,找三五本本領(lǐng)域的10分以上期刊把里面近三個月以來所有的有關(guān)分子的文章都找出來看完之后把有差異的分子列個表,然后一樣的看文獻(xiàn)讀綜述排除缺陷分子后留下兩三個分子做實(shí)驗(yàn)。
 

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