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上次分不清幾種基因修飾小鼠的人已經涼了

 嘿實驗室 2018-08-31

轉基因小鼠常用于基因的過表達。根據制備策略,分為隨機轉基因和定點轉基因。隨機轉基因是將過表達載體注射到受精卵中,表達載體以隨機方式插入基因組,首建鼠可能有多個位點插入,每個插入位點可能含有多個表達載體拷貝。這個特點導致有的轉基因小鼠會發(fā)生表達沉默,因此需要對小鼠進行表達篩選,篩出正確表達的小鼠,進行建系才能用于后續(xù)實驗。定點轉基因是將基因表達載體插入到基因組特定位點上,如 Rosa26 位置,研究證明,這個位置不容易發(fā)生表達沉默,與隨機轉基因相比,優(yōu)勢是表達確定,但制備相對復雜,成本和周期增加。


圖 1:轉基因小鼠制備示意圖

來源:Yale J Biol Med. 2011 Jun;84(2):117-124


基因敲除小鼠

    費用逐漸降低    


傳統(tǒng)策略是通過同源重組的方式,用 Neo 基因替換或刪除關鍵外顯子來敲除基因,其周期長,費用高。TALEN,CRISPR 技術出現后,加速了基因敲除鼠的制作,而且降低了費用。CRISPR 切割 DNA 后,會引起的非同源末端修復(NHEJ),這種修復有一定的隨機性,如果插入或刪除非 3 的整數倍的核苷酸,會發(fā)生移碼突變,造成基因敲除。移碼突變的策略只需要單個 gRNA,但是后期檢測一般需要測序,或者用分辨率更高的 Page 膠電泳,檢測相對復雜,成本較高。


圖 2:基因敲除小鼠制備示意圖


這里有個需要注意的雷是某些敲除雖然發(fā)生了移碼,但是蛋白水平檢測發(fā)現,未能敲除目的基因。目前維通達采用雙 gRNA 策略,刪除關鍵外顯子或整個目的基因,確保有效敲除目的基因,由于刪除了一個大的片段,PCR 檢測時,敲除小鼠很容易與野生型區(qū)別。


條件敲除小鼠

敲除致死的唯一模型


當目的基因敲除致死時,只能做條件敲除,常用 Cre-loxp 系統(tǒng)。那么如何操作呢?方法是在要敲除的區(qū)域兩側插入 loxp,得到的 floxed 小鼠與組織特異表達 Cre 的小鼠雜交,在 Cre 的作用下,兩個 loxp 之間的區(qū)域被刪除,可以實現在特異的組織敲除目的基因。條件敲除雖然也是敲除,但是制備這種小鼠實際是要定點插入 loxp 序列。


圖 3:條件敲除小鼠制備示意圖


點突變小鼠

可模擬單個堿基突變引起的疾病


某些疾病由單個堿基突變引起,通過突變小鼠的相應堿基可以模擬。CRISPR 打斷 DNA 的同時,提供含有目的突變的單鏈修復模板,能夠有效地建立點突變小鼠。影響點突變效率的主要因素是,該點突變附近有沒有高效率切割 DNA 的 gRNA,如果有,是比較幸運的,如果沒有,可以選取鄰近的 gRNA,這可能造成二次切割,需要引入同義突變。在這里提醒大家,切割位點離突變位點越遠,突變效率越低。


圖 4:點突變小鼠制備示意圖


基因敲入小鼠

制備基因人源化小鼠


CRISPR 打斷 DNA 的同時,提供打靶載體,能夠敲入外源 DNA。當需要敲入長度較小 DNA 片段時,CRISPR 能夠有效地提高效率,如維通達制作的免疫檢查點基因 PD1,CTLA4,Tim3,和 LAG3 的人源化小鼠,都是通過 CRISPR 技術,將小鼠的基因替換成人源的基因。對于 GFP 等各種標簽的插入也可以用 CRISPR 來幫助制備。


圖 5:基因敲入小鼠制備示意圖


基于 ES 的傳統(tǒng)打靶

EPS 細胞助力節(jié)省 3 個月研究時間


雖然 TALEN 和 CRISPR 出現后,大大提高了基因編輯的能力,但 CRISPR 等技術也并非全能。隨著敲入片段長度的增加,大于 1kb 的片段時,CRISPR 等技術效率逐漸下降,而傳統(tǒng) ES 打靶周期長,費用高。由北京大學和維通達共同合作研發(fā)獲得的 EPS 細胞(cell 期刊號:169(2):243-257.e25.),具有超強的胚胎嵌合能力,一個 ES 細胞注入囊胚,就可以直接生出 ES 小鼠,越過嵌合鼠的步驟,節(jié)省三個月的時間,費用也大為節(jié)省。


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