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三種分析蛋白結(jié)構(gòu)域(Domains)的方法

 王的宮殿7hgg9t 2018-07-05

1,SMART入門,蛋白結(jié)構(gòu)和功能分析

詳細(xì): http://www./?p=738

2,Sanger的Pfam數(shù)據(jù)庫(kù)

網(wǎng)址:http://pfam./

目前的版本:Pfam 23.0 (July 2008, 10340 families)

The Pfam database is a large collection of protein families, each represented by multiple sequence alignments and hidden Markov models (HMMs).

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3,NCBICDD(Conserved Domain Database)數(shù)據(jù)庫(kù)

網(wǎng)址:http://www.ncbi.nlm./Structure/cdd/wrpsb.cgi

Proteins often contain several modules or domains, each with a distinct evolutionary origin and function. NCBI’s Conserved Domain Database is a collection of multiple sequence alignments for ancient domains and full-length proteins.

三種分析蛋白結(jié)構(gòu)域(Domains)的方法

最后,自己試驗(yàn)一下。上面兩個(gè)圖的結(jié)果的數(shù)據(jù)是用了NP_776850的蛋白序列。你也可以拿這個(gè)序列來(lái)運(yùn)行一下看看。
本文詳細(xì)出處參考柳城博客:http:///

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