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代謝組學研究報告中應該提供的基本信息丨色譜 & 質譜

 terminator_523 2018-01-25

 

色譜方法相關的信息

大部分的以質譜為基礎的代謝組學研究在樣品引入時都需要與色譜儀器相連。因此在研究中提供詳細的色譜參數(shù)非常必要,在這里就對色譜分離中應該提供的信息給出以下參考。

1. 色譜儀器的描述

  • 生產廠家、產品型號、軟件名稱和版本

2. 自動進樣器

  • 進樣注射器的型號/大小,軟件版本,進樣體積,清洗流程和溶劑

3. 分離色譜柱和預柱或保護柱

  • 生產廠家,產品名稱或編號,固定相組成(如:硅膠、C18等),物理參數(shù)(如:氣相色譜柱的涂層厚度、液相色譜柱的粒徑),色譜柱的內徑和長度

4. 與技術相關的樣本前處理過程

  • 樣品復溶的溶劑(如:用流動相復溶),進樣量

  • 衍生化反應的條件(如:衍生化試劑、生產廠家、反應溫度和時間等)

  • 內標的加入

5. 分離參數(shù)

  • 方法的名稱(可用于發(fā)表和引用的詳細方法),進樣器溫度,分流和分流比,流動相組成,流速,壓力,洗脫梯度


 

 

質譜方法的相關信息

  • 質譜是在代謝組學應用中很普遍使用但是很復雜的一項技術。因此,為了保證實驗的可重復性,需要研究者們在研究報告中提供詳細的質譜參數(shù),以下信息供參考。

1. 儀器描述

  • 生產廠商,儀器型號,軟件(名稱、序列號、版本)

2. 樣品引入

  • 從氣相色譜、液相色譜還是直接進樣進行檢測,如果是直接進樣還需列出進樣器的型號和流速

3. 離子源

  • 電離模式(EI、APCIESI等),檢測模式(正、負離子模式分析),真空度,電壓(如:毛細管電壓),氣體流速(霧化氣、錐孔氣體等),離子源溫度。雖然這些參數(shù)在不同的儀器上數(shù)值會有一些差異,但是研究者還是應該提供可以使實驗得以重復的充足的參數(shù)信息。

4. 質量分析器和數(shù)據(jù)采集模式

  • 質量分析器類型(四級桿、離子阱、飛行時間等,以及它們的聯(lián)用形式如Q-TOF等),數(shù)據(jù)采集模式(fullscanMSn、SIM、MRM等)

6. 與技術相關的樣品前處理過程

  • 樣品復溶的溶劑(如:含有0.2%甲酸的甲醇: 1:1溶液),衍生化方法,進樣體積,內標物質的加入

7. 數(shù)據(jù)采集的參數(shù)

  • 數(shù)據(jù)采集的日期,操作者,數(shù)據(jù)采集速度,質荷比范圍,所使用的質量軸校正物質,質譜的分辨率和質量精度,質譜圖采集頻率,真空度,實時校正溶液(濃度,質核比,流速和采集頻率)


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