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ggplot2繪圖入門——基礎(chǔ)圖形篇

 阿非ycfg 2017-09-14

Hello,大家好,開學了,Omicshare課堂也再次上線。


請問,在Omicshare近40期的課程里面,最火的課程是什么


第12期的課程《R語言入門》是當仁不讓的第一。課程上線后,目前累計的點擊率已經(jīng)超過13,000次,火爆的一塌糊涂??梢奟語言對于從事生物學研究的同行們,是多么的實用。第39期,我們將給大家?guī)砹硪粋€實用的教程——《ggplot2入門》,屬于《R語言入門》的姊妹篇。


圖1 第12期課程《R語言入門》


如果經(jīng)常接觸測序類文章或資料的你,一定很熟悉以下這樣的圖形(圖2)。這樣的圖形往往就是使用R包ggplot2繪制的。雖然在Omicshare tools網(wǎng)站(http://www./tools/index.php/)也可以繪制,但如果你自己掌握相關(guān)的分析和繪制方法,無疑對科研數(shù)據(jù)的挖掘和呈現(xiàn)能力又會更上一層樓。正所謂技多不壓身!


圖2 一些常見的二代測序數(shù)據(jù)相關(guān)的圖形(分別是火山圖,氣泡圖,堆疊圖)


如果把R語言看成一個國家的話,ggplot2作為一個R語言包,相當于一個自治區(qū),有它自己的數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)和分析邏輯。雖然一開始你可能不適應它的邏輯,但一旦掌握以后,就可以非常高效的利用它繪制出精美的圖形。在我們之前的電子書分享中,也介紹過一本專門介紹ggplot2的電子書教程(電子書分享|領(lǐng)略ggplot2圖形藝術(shù),http://www./forum/thread-510-1-12.html)。


PS:這本電子書目前的下載量也達到了異常高的6200次。



但無論如何,看電子書入門學習的速度,也不如有人手把手給你解說如何使用ggplot2。本期ggplot2的入門教學視頻,一共3個學時。我們將以最常見的6種圖形作為案例,向你示范ggplot2數(shù)據(jù)整理和圖形繪制的方法。相信對你可以舉一反三,快速掌握ggplot2的用法。而且教程中,也包含大量成熟的腳本,方便你將來要使用的時候隨時調(diào)用。


圖3 本次教程涉及的6類圖形


圖4 隨意感受一下課程中你可以掌握的圖形

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