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實戰(zhàn)|利用SPSS進行生存分析

 沙亮哥哥 2017-09-03

用SPSS軟件進行生存分析

給大家介紹3種常用方法

壽命表法、Kaplan-Meier分析法、Cox回歸分析

一、壽命表分析

適用于大數(shù)據(jù)

示例:
若要研究性別對于肺病生存率有無區(qū)別,收集數(shù)據(jù)下列信息
time:生存時間(單位天)
status:0=存活,1=死亡
sex:1=男,2=女

操作步驟
按步驟將數(shù)據(jù)導入(lung數(shù)據(jù)集來自于R內置數(shù)據(jù))


選定壽命表分析方法

對各選項進行設置

(其中注意狀態(tài)設置:選取表示事件已發(fā)生的值)


設置完所有選項后確認

得到結果(可進行導出)


1.得到存活表:

該表給出了男女對應時間內存活和死亡人數(shù),并計算了存活率、風險比等統(tǒng)計量


2.中位數(shù)生存時間:

即生存率為50%時,生存時間的平均水平;

可知:生存時間的平均水平女士高于男士

3.生存函數(shù):男士較女士累計生存率下降快

二、Kaplan-Meier分析

適用于小樣本
示例:
若要研究藥物治療對卵巢癌生存率有無區(qū)別,收集數(shù)據(jù)下列信息
futime:生存時間(單位天)
fustat:0=存活,1=死亡
rx:1=未治療,2=治療

操作步驟:
按步驟將數(shù)據(jù)導入(ovarian數(shù)據(jù)集來自于R內置數(shù)據(jù))


選定Kaplan-Meier分析法,并對選項進行設置

設置結束后確認,得到結果(可進行導出)

1.生存表的均值和中位數(shù)、百分位數(shù):

可以看出治療與未治療有均值、四分位數(shù)略有差異


2.整體比較:

檢驗結果p值>0.05,證明治療組與非治療組差異不顯著


3.存活函數(shù):治療組較非治療組生存結果好,但從假設檢驗結果來看差異不明顯

三、Cox回歸分析

示例:
若要研究結腸癌治療方式對患者生存時間的影響,收集了下面所示的數(shù)據(jù):
time:生存時間(單位天)
status:0=存活,1=死亡
rx:治療方式,Obs=觀察,Lev=方式1,Lev+5FU=方式2
obstruct:0=無阻塞的結腸腫瘤,1=有阻塞的結腸腫瘤
perfor:0=無結腸穿孔,1=有結腸穿孔
extent:傳播程度:1 =黏膜下層,2 =肌肉,3 =漿膜,4 =相鄰結構


操作步驟:
導入結腸癌colon數(shù)據(jù)(R中內置數(shù)據(jù))


選定cox回歸分析

參數(shù)設置:
協(xié)變量依次導入,方法按分析所需進行選擇


點擊'分類',協(xié)變量依次選入分類協(xié)變量

點擊'繪圖',勾選生存函數(shù),主要變量為rx,將rx變量選入單線框中,繪制生存曲線



點擊'選項',設置輸出RR的95%置信區(qū)間。


最后確定

得到結果(可導出)
1.案例處理摘要:1858個樣本,其中920個死亡,938個存活,無缺失值存在


2.分類變量編碼:分類變量編碼方式及頻數(shù)


3.擬合模型檢驗:原假設是“所有影響因素的偏回歸系數(shù)均為0”,這里可以看出P<>


4.方程式中變量:多元回歸結果,第二列B為偏回歸系數(shù),最后三列為OR值及其置信區(qū)間。


5.協(xié)變量均值處的生存函數(shù):總體的生存函數(shù)?;颊呱媛氏陆递^快。


6.生存函數(shù):在控制了其他變量后,有無治療的生存函數(shù)對比,可以直觀看出,接受Lev+5FU治療的患者的生存情況優(yōu)于未接受治療Obs和接受治療Lev的患者。

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