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對基因檢測,你有很多問題(上)?

 藍調(diào)閑人 2017-06-22
腫瘤的治療,已經(jīng)從千篇一律的傳統(tǒng)治療,逐步發(fā)展到了“量體裁衣”的“精準醫(yī)學”時代;基因檢測,是精準醫(yī)學時代的腫瘤診治,無法繞開的核心話題。
  什么是基因檢測?
  基因是生命體的遺傳物質(zhì)。癌細胞與正常細胞,有很多不同;其中,最重要的不同就是癌細胞中不少基因是變異的:有的基因缺失了,有的基因重復了,有的基因長歪了……利用各種方法,把這些變異的基因找出來,仔細分析,可以協(xié)助臨床診斷、指導治療選擇、輔助監(jiān)測疾病復發(fā)和耐藥、預估生存期等。
  有一些非常難以確診的腫瘤,需要依靠特定的基因改變協(xié)助確診。比如,不少肉瘤都長的像梭子一樣,長長扁扁的,這時候如果基因檢測發(fā)現(xiàn)有ASPL-TFE3融合基因,那診斷腺泡軟組織肉瘤,就八九不離十了。
  晚期肺腺癌病友,超過一半都攜帶EGFR、ALK、ROS-1等基因突變,這類病人就有機會嘗試靶向藥了,有效率高、副作用小、生存期相對較長。咚咚腫瘤科甚至分享過,依靠靶向藥聯(lián)合傳統(tǒng)放化療,生存期超過10年、20年的超級幸運案例。
  什么人需要做基因檢測?
  廣義上講,所有腫瘤患者均可以接受基因檢測;狹義上講,根據(jù)指南推薦,不同的病種、不同的分期、出于不同的目的,不同的患者,適合做不同的基因檢測。
  比如,一個晚期肺腺癌患者,尚未接受任何治療,家庭經(jīng)濟情況一般,只是為了看看,是否有合適的已經(jīng)在內(nèi)陸上市的靶向藥可用,那么只要測一下最常見的那幾個基因就可以了,比如咚咚腫瘤科為大家精選的這款套餐只有包含最重要的11個基因(表格中的10個基因再加大名鼎鼎的TP53基因)。

  如果想測最近超火的NTRK1基因融合,肺癌31基因(6800元)和精華版24基因(5800元)都有包含。
  比如,一個超級土豪,是一個肉瘤,其他藥物治療都失敗了,但是依然想碰碰運氣,看看是不是自己還有靶向藥可用:不管是已經(jīng)上市還是處于臨床試驗研究階段的,不管是國內(nèi)還是國外,都想知道。那么,他或許可以選擇做一下跨癌種的、盡可能多的、幾十上百甚至全部的基因。基于這個目的的話,我們有550個基因的、全外顯子組(3萬多個基因)的,甚至還有基因檢測的金標準——FOUDATION ONE的343個靶向基因檢測(包含TMB分析結(jié)果,等于做一個基因檢測可以同時看靶向藥物和免疫藥物是否合適,一網(wǎng)打盡~)可供選擇。
  是不是所有靶向藥,都要做基因檢測?
  不是??寡苌蔀橹鞯陌邢蛩?,如貝伐單抗、瑞格非尼、阿帕替尼、索拉菲尼、舒尼替尼、樂伐替尼、卡博替尼、西地尼布、olaratumab等新藥,并不一定需要做基因檢測——因為,現(xiàn)在并不知道,哪個或者哪幾個基因變異,與這些藥物的療效有相關(guān)性。
  組織和血液,到底選哪一個?
  目前依然以組織病理切片的基因檢測,準確度最高,是業(yè)內(nèi)公認的金標準。雖然它也不是100%完美(比如還有空間、時間、異質(zhì)性的問題)。但是,常常能遇到病友無法取得足夠的組織,或者組織標本年代久遠,這類情況下,也可以考慮用血液標本勉強代替。我們一般推薦的優(yōu)劣順序是:最近手術(shù)或活檢新取的組織標本>1-2年內(nèi)的組織標本>最新的血標本>2年以上的舊的組織標本。
  目前主流的基因檢測方法是測序,那么用血液標本代替組織標本,準確度大約是70%-80%;此外,對于一些非常成熟的、少數(shù)幾個明確的基因位點,比如EGFR T790M等,已經(jīng)有上市的數(shù)字PCR法來檢測,準確度可以提高到90%左右——測序法雖然準確度稍低,但是可以同一份樣本測幾十、上百甚至幾萬個基因;而數(shù)字PCR法雖然準確度大幅度提升,但是每次只能測一兩個,兩三個明確的基因位點(目前可選擇T790M/19DEL/L858R這些主流位點)——咚咚腫瘤科的合作伙伴里,既有能提供測序法一次性測550個基因的、也有能提供極高準確度數(shù)字PCR法檢測特定單個基因的,供你挑選。
  血液基因突變動態(tài)監(jiān)測,有什么用?
  血液中基因突變的濃度變化,很大程度上可以反映病情的變化,甚至有時候比影像學更提前,比腫瘤標志物更準確。
  因此,對于一些攜帶非常常見的基因突變的病人,如果碰巧腫瘤標志物又不敏感,那么利用血液基因檢測(就檢測那一兩個最常見的基因突變即可,價格可承受),每隔2-3個月測一次,通過基因突變的濃度變化和性質(zhì)改變,可以提前發(fā)現(xiàn)疾病復發(fā)、提前預警藥物耐藥等。對于攜帶EGFR突變且口服靶向藥治療的病人,如果每隔2個月測一次血液中EGFR相應突變的濃度變化,國內(nèi)外的眾多研究提示,可以比影像學平均提前4-6個月發(fā)現(xiàn)耐藥。
  未完待續(xù),下篇更精彩
  參考文獻:
  [1]Thress KS, Brant R, Carr TH, Dearden S, et al. EGFR mutation detection in ctDNA from NSCLC patient plasma: A cross-platform comparison of leading technologies to support the clinical development of AZD9291. Lung Cancer. 2015 Dec;90(3):509-15
  [2]Kim J, Park WY, Kim NKD, et al. Good Laboratory Standards for Clinical Next-Generation Sequencing Cancer Panel Tests. J Pathol Transl Med. 2017 May;51(3):191-204
  [3]Dey N, Williams C, Leyland-Jones B, De P. Mutation matters in precision medicine: A future to believe in. Cancer Treat Rev. 2017 Apr;55:136-149

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