1583年，對(duì)于舒爾哈齊來(lái)說(shuō)是一個(gè)永遠(yuǎn)難忘的一年，他的祖父和父親死在了明朝的亂軍之中。舒爾哈齊與兄長(zhǎng)兩人悲痛欲絕，雙雙離開(kāi)了明軍，回到了家中。經(jīng)過(guò)一番深思之后，兩人決定為死去的親人報(bào)仇，依靠著祖父遺留下來(lái)的十三副鎧甲起兵，拉起了一支百余人的隊(duì)伍，開(kāi)始了創(chuàng)建后金的偉大事業(yè)。

在血與火的創(chuàng)業(yè)歲月中，舒爾哈齊成為了兄長(zhǎng)努爾哈赤的得力助手和主要戰(zhàn)將，但是隨著力量的壯大和權(quán)利欲的增加，他開(kāi)始居功自傲起來(lái)。漸漸不滿足于自己的地位，意圖和兄長(zhǎng)分享權(quán)利，形成了對(duì)努爾哈赤領(lǐng)導(dǎo)權(quán)威的挑戰(zhàn)，但是在殘酷的權(quán)利斗爭(zhēng)中，舒爾哈齊他失敗了，他輸了，而且也因此被拘禁直到他死去。人一有了權(quán)利和財(cái)富就迷失了本性，開(kāi)始亂了心性，做出了不合時(shí)宜的事。不過(guò)對(duì)于舒爾哈齊的功績(jī)不能抹滅，他能征善戰(zhàn)，功績(jī)卓越。在努爾哈赤艱苦的創(chuàng)業(yè)過(guò)程中，舒爾哈齊是他堅(jiān)定的支持者，他以他的軍事才能贏得了多次勝利，為此他不光得到了巨大的聲望，同時(shí)他的政治地位和軍事實(shí)力，也隨著建州女真的發(fā)展壯大而不斷提高。1587年，努爾哈赤在費(fèi)阿拉稱汗，舒爾哈齊被封為貝勒，地位僅次于他的兄長(zhǎng)，成為第二號(hào)人物。他麾下?lián)碛芯迩?，?zhàn)將四十余員，成為女真部落十足的實(shí)力派人物。

1595年八月，舒爾哈齊首次帶領(lǐng)建州女真朝貢使團(tuán)前往北京進(jìn)貢，這次的經(jīng)歷使他眼界大開(kāi)。他對(duì)自己屈居在兄長(zhǎng)的屬下的地位感到不滿，他希望有朝一日他能夠位極人君之尊，當(dāng)上建州女真的最高統(tǒng)治者。與此同時(shí)他對(duì)先進(jìn)的農(nóng)耕文明和文化產(chǎn)生了濃厚的興趣。

1597年七月，舒爾哈齊第二次進(jìn)北京朝貢，這次的經(jīng)歷更助長(zhǎng)了他的野心。他到達(dá)北京后受到了明朝廷熱烈隆重的接待，并被賞賜給了豐厚的金銀綢緞等禮物。同時(shí)，明廷還授予了他都指揮的高級(jí)武職。明朝以此做為一種戰(zhàn)略對(duì)策，盡力拉攏和收買努爾哈赤的對(duì)手及反對(duì)者，在兩者間進(jìn)行挑撥，以激化彼此的矛盾，達(dá)到一箭雙雕的目的。對(duì)于舒爾哈齊這樣的人物，明朝更是希望將他拉攏過(guò)來(lái)為己所用，以便在努爾哈赤的集團(tuán)內(nèi)部安進(jìn)一個(gè)棋子，來(lái)分化、削弱努爾哈赤的力量。為此舒爾哈齊也確實(shí)感激明朝的恩寵，他感恩于明朝，在政治態(tài)度上越來(lái)越傾向于明朝。

舒爾哈齊除了積極的與明朝發(fā)展密切關(guān)系之外，他還通過(guò)政治聯(lián)姻的形式加強(qiáng)與其他各個(gè)女真部落的聯(lián)系，借以擴(kuò)大他的個(gè)人實(shí)力和影響。例如1596年他娶了烏拉部落的酋長(zhǎng)布占泰的妹妹為妻，第二年他又將自己的女兒額實(shí)泰嫁給了布占泰，就這樣他與烏拉部落就結(jié)成了牢固的同盟，不過(guò)他與布占泰的關(guān)系有點(diǎn)亂，他又是布占泰的妹夫又是他的岳父，不過(guò)就因?yàn)榇怂麄€(gè)人的政治影響也逐漸與努爾哈赤平分秋色，并駕齊驅(qū)。

舒爾哈齊同樣也與朝鮮保持著相當(dāng)密切的關(guān)系，朝鮮使者到建州，對(duì)于努爾哈赤和舒爾哈齊見(jiàn)面行相同的禮儀，并向兩人饋贈(zèng)同樣的禮物。他們二人也分別屠宰豬羊，各自在帳中款待朝鮮使者，并回贈(zèng)禮物。朝鮮國(guó)王也樂(lè)意在兩位建州首領(lǐng)之間周旋，對(duì)他們實(shí)行雙重承認(rèn)的原則，這與明朝的手法如出一轍。

隨著女真各部的統(tǒng)一，努爾哈赤擁有了足夠的力量與明朝對(duì)抗，他對(duì)明朝的敵視態(tài)度也日益明顯，他的下屬也時(shí)常和明軍發(fā)生武裝沖突。明朝對(duì)遼東的局勢(shì)感到不安。1601年明廷又起用了被罷免的前遼東總兵李成梁，希望他能扭轉(zhuǎn)當(dāng)時(shí)那惡劣的局勢(shì)。

李成梁上任伊始，就采用了原來(lái)對(duì)女真各部的分化瓦解政策。他利用了舒爾哈齊和他兄長(zhǎng)的矛盾，大力拉攏他，對(duì)他恩禮有加，格外器重。李成梁讓兒子李如柏娶了舒爾哈齊的女兒為妾，使雙方關(guān)系更為緊密。1605年，舒爾哈齊的妻子病故，李成梁父子準(zhǔn)備了豐厚的祭禮前去治喪，備極隆重。面對(duì)明朝的恩寵，舒爾哈齊更加感激，他決心依靠明朝為后臺(tái)，樹(shù)立自己的女真最高領(lǐng)袖的地位。

舒爾哈齊明目張膽地樹(shù)立個(gè)人的權(quán)威，逐漸構(gòu)成了對(duì)努爾哈赤地位的挑戰(zhàn)，兩人的關(guān)系也日益緊張，在諸貝勒共同參加的會(huì)議上，兩人常因意見(jiàn)相左而激烈爭(zhēng)吵，努爾哈赤開(kāi)始意圖除去他這個(gè)潛在的對(duì)手。

機(jī)會(huì)終于來(lái)臨，1607年三月，居住在蜚悠城的一小支女真部落，由于不堪忍受臨近的烏拉部的奴役，想來(lái)依附努爾哈赤。努爾哈赤對(duì)此自然十分高興，于是他就派出了舒爾哈齊和自己的兒子褚英、代善，將領(lǐng)費(fèi)英東、揚(yáng)古利、常書(shū)、扈爾汗領(lǐng)兵三千，前往蜚悠城收編該部。

當(dāng)舒爾哈齊等人行至半途的時(shí)候，他就滿腹狐疑的對(duì)同行的將領(lǐng)說(shuō)看到帥旗上有一層淡淡的幽光，想要退兵。顯然這是他為退兵所想的借口，不想執(zhí)行這一使他為難的任務(wù)，不過(guò)在褚英、代善的反對(duì)下，只能作罷。到達(dá)蜚悠城后，該部落酋長(zhǎng)策穆特黑帶領(lǐng)的五百戶人丁早以做好了出發(fā)的準(zhǔn)備，于是很快這支隊(duì)伍就踏上了返回的道路。

烏拉貝勒布占泰得知消息后，立即帶領(lǐng)一萬(wàn)騎兵趕來(lái)攔擊，雙方軍隊(duì)擺出了交戰(zhàn)的陣勢(shì)。但這時(shí)，舒爾哈齊卻帶著自己屬下的五百人退到了一邊，他不想破壞與姻親的友好關(guān)系。只有褚英、代善率軍英勇奮戰(zhàn)，舒爾哈齊只在一邊觀看，他的部下常書(shū)、納齊布也沒(méi)有加入戰(zhàn)斗。正是由于舒爾哈齊的消極退避，最后褚英、代善雖然打敗烏拉騎兵，但是沒(méi)能給以致命打擊。

舒爾哈齊班師回朝之后，努爾哈赤準(zhǔn)備將他的下屬常書(shū)、納齊布以臨陣脫逃的罪名處死，以剪除他的左膀右臂同時(shí)也是殺雞儆猴。但是舒爾哈齊的反應(yīng)十分強(qiáng)烈，說(shuō)殺他們就是等于殺我，誓不低頭，大有決以死戰(zhàn)的陣勢(shì)。最后努爾哈赤為了避免公開(kāi)的沖突，便做出了讓步。他只罰了常書(shū)一百兩黃金，奪了納齊布下屬的人馬，并且從此以后剝奪了舒爾哈齊指揮軍隊(duì)的權(quán)利，將他排擠出了最高軍事領(lǐng)導(dǎo)層。

舒爾哈齊的地位由此一落千丈，他變成了一個(gè)有名無(wú)實(shí)的人物，這是他憤恨難平，痛感自己與努爾哈赤勢(shì)難并存。于是，他與長(zhǎng)子阿爾通阿，三子扎薩克圖商議，圖謀另立門戶，與兄長(zhǎng)分庭抗禮。

于是舒爾哈齊帶著幾個(gè)兒子和少數(shù)部下來(lái)到了鐵嶺東南的黑扯木，在那里伐木建造房屋，開(kāi)辟新的根據(jù)地。而黑扯木臨近明朝的軍事重鎮(zhèn)鐵嶺，可以直接依靠明朝的軍事保護(hù)，在他的東面又與烏拉部落接鄰，能隨時(shí)得到盟友的援助。舒爾哈齊開(kāi)始與努爾哈赤越來(lái)越疏遠(yuǎn)了，轉(zhuǎn)而靠近明朝了。李成梁看到這一分化女真的大好機(jī)會(huì)，于是火上澆油，故意挑起矛盾沖突。他上奏朝廷冊(cè)封舒爾哈齊為建州右衛(wèi)首領(lǐng)，這是明朝在遼東地區(qū)設(shè)立的最高地方軍事長(zhǎng)官。如果明朝的這一分化策略成功的話，女真就極有可能再次分裂，這是明朝所愿意看到的，但是他們并沒(méi)有如愿以償，這一局面并沒(méi)有出現(xiàn)。

努爾哈赤再也無(wú)法容忍自己親弟弟的分裂行為。他首先是責(zé)令舒爾哈齊放棄自立為王的念頭，在勸說(shuō)無(wú)效的情況下，他斷然采取了強(qiáng)硬措施，于1609年三月，舒爾哈齊的兩個(gè)兒子阿爾通阿、扎薩克圖被努爾哈赤誅殺，部將武爾坤也被處死。努爾哈赤余怒未消，仍打算將他的次子阿敏處死，只是在皇太極等人的極力求情下，阿敏才逃過(guò)一劫，免于一死，不過(guò)他的一半家產(chǎn)被沒(méi)收。但是這次的事件，使阿敏在心里產(chǎn)生了和他父親一樣的想法——反叛伯父。

面對(duì)兄長(zhǎng)咄咄逼人的姿態(tài)，舒爾哈齊失去了繼續(xù)抗?fàn)幍挠職?。他知道自己的?shí)力遠(yuǎn)遠(yuǎn)不如兄長(zhǎng)，而且他所指望的靠山，駐扎在遼東的明軍，也處在岌岌可危的境地，根本不是努爾哈赤的對(duì)手。在萬(wàn)念俱灰的絕望處境下，舒爾哈齊回到了兄長(zhǎng)的帳下。

但是這次的努爾哈赤對(duì)他不再講兄弟情誼了，舒爾哈齊被囚禁在一間暗室之中，用鐵鎖鎖住，僅有兩個(gè)孔穴給他送食物。

史書(shū)上記載說(shuō)：“弟貝勒仍不滿其兄聰睿恭敬汗之待遇，不屑天賜之安樂(lè)生活，遂于辛亥年（萬(wàn)歷三十九年）八月十九日卒?！保ā稘M文老檔》上，第一冊(cè)）

1611年八月十九日（9月25日），舒爾哈齊在囚禁中死去，時(shí)年四十八歲。據(jù)說(shuō)，他是被兄長(zhǎng)努爾哈赤秘密殺害的，不過(guò)這是清初的幾個(gè)疑案之一，真相究竟如何已不得而知。不過(guò)他死后，他的后代并沒(méi)有因他的反叛行為而獲罪，六子濟(jì)爾哈朗還成為了以后的輔政王，掌管清廷政權(quán)一時(shí)，這是后話了。

順治十年1653年，清廷追封他為和碩莊親王。這時(shí)，距離他死已有四十年了。

舒爾哈齊有子九人，其中有爵者五人：阿敏、圖倫、寨桑武、濟(jì)爾哈朗、費(fèi)揚(yáng)武