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大家說(shuō)的轉(zhuǎn)錄調(diào)控到底是什么?(上)

 微笑如酒 2017-01-13

聊聊跟科研有關(guān)的感想心得,如基金,文章和實(shí)驗(yàn)。

經(jīng)典的中心法則是指遺傳信息從DNA傳遞給RNA,再?gòu)腞NA傳遞到蛋白質(zhì),完成遺傳信息的轉(zhuǎn)錄與翻譯過(guò)程。


大家看到這個(gè)過(guò)程包括轉(zhuǎn)錄和翻譯,轉(zhuǎn)錄是中心法則的第一步,即是從DNA到RNA信息傳遞的過(guò)程。近期我們先來(lái)就轉(zhuǎn)錄給大家科普,今天是第一期:組蛋白修飾。

轉(zhuǎn)錄過(guò)程是發(fā)生于細(xì)胞核內(nèi)的,這就是為什么大家發(fā)現(xiàn)分子定位于細(xì)胞核,就推斷分子從轉(zhuǎn)錄水平發(fā)揮功能的。


組蛋白修飾——染色質(zhì)開放程度

核小體是染色質(zhì)的基本構(gòu)成單位,由組蛋白和DNA組成。組蛋白由于含有帶正電荷的氨基酸,如賴氨酸(Arg,縮寫為R)和精氨酸(Lys,縮寫為K),因此帶正電,而DNA帶負(fù)電,因此兩者吸附結(jié)合到一起,通過(guò)這樣的方式DNA中的遺傳信息被壓縮。


多說(shuō)一句:DNA帶負(fù)點(diǎn),高中生物實(shí)驗(yàn)里用玻璃棒來(lái)纏繞得到DNA就是這個(gè)原理。

基因轉(zhuǎn)錄發(fā)生的第一步就是染色質(zhì)從緊密變?yōu)樗缮?,即染色質(zhì)的開放程度提高,這樣后續(xù)的轉(zhuǎn)錄因子才能結(jié)合到DNA上。組蛋白修飾就是調(diào)控染色質(zhì)緊密程度的一個(gè)關(guān)鍵因素。

常見的組蛋白修飾是甲基化和乙酰化。即由于組蛋白中正電荷氨基酸,如賴氨酸K被添加甲基,導(dǎo)致正電荷變少,因此與DNA結(jié)合能力降低,結(jié)果就是染色質(zhì)被打開。

  1. 組蛋白有六種:H1、H2A、H2B、H3、H4及古細(xì)菌組蛋白;

  2. 每種蛋白里面能夠發(fā)生修飾的氨基酸又有很多種,比如賴氨酸(K)和精氨酸(R);

  3. 每種氨基酸能否發(fā)生的修飾類型也有很多種,比如甲基化(me)和乙酰化(ac);

  4. 每種修飾又有數(shù)量不同,比如甲基化有1甲基化,2甲基化和3甲基化。

所以我們看到這樣的詞H3K27me3時(shí),意思就是組蛋白H3肽鏈中的27位賴氨酸上有三個(gè)甲基。

大家可以看一下組蛋白修飾的復(fù)雜程度:


而這些組蛋白修飾對(duì)基因表達(dá)的調(diào)控效果又是不同的:


下面我們?cè)僬f(shuō)一個(gè)概念:參與組蛋白修飾的酶,根據(jù)修飾類型分為甲基化酶、乙?;?/strong>等等,再看起是促進(jìn)還是抑制作用,又包括甲基化酶和去甲基化酶,乙?;负腿ヒ阴;?。一般把添加修飾的叫Writer,把去除修飾的叫Eraser。


最后打個(gè)比喻,組蛋白修飾導(dǎo)致染色質(zhì)開放程度增加,就像解壓文件的過(guò)程,文件處于被壓縮狀態(tài)是不能讀取的,只有解壓以后才能讀??;同樣的,父母各傳下來(lái)一套處于壓縮狀態(tài)的染色體,只有解壓以后才可能被轉(zhuǎn)錄,但是解壓只是被轉(zhuǎn)錄的第一步,至于解壓出來(lái)的文件你有沒有對(duì)應(yīng)的軟件打開,就是下面的問(wèn)題了。

有點(diǎn)像:

每個(gè)人死后都會(huì)變成一本書。書的內(nèi)容就是那個(gè)人的生平。有人成了圣經(jīng),有人成了名著,有人成了禁書,有人成了樂(lè)譜,有人變成菜譜,有人變成地圖…..整個(gè)世界就是一個(gè)巨大的圖書館,我們讀著別人,做著自己,等著被讀。你會(huì)是什么書?

That's all. Thank you!

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