隨著影像技術(shù)的發(fā)展和精準(zhǔn)醫(yī)療的推進(jìn),影像基因組學(xué)在精準(zhǔn)醫(yī)療領(lǐng)域尤其是腫瘤的精準(zhǔn)診療中將會(huì)發(fā)揮重要作用。在2016“西湖論健“國(guó)際高峰論壇上,來自杭州電子科技大學(xué)生命信息與儀器工程學(xué)院的厲力華教授與我們分享了影像基因組學(xué)與腫瘤精準(zhǔn)診療相關(guān)的話題。 整理:趙成龍
精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)與腫瘤的精準(zhǔn)治療 如今精準(zhǔn)醫(yī)療、大數(shù)據(jù)等詞匯都非常火熱,其中大數(shù)據(jù)很多都來自于基因組。那么現(xiàn)在我們也有這樣的問題,即是否有可能將影像學(xué)的東西和基因組學(xué)的東西連接起來,打通兩者的關(guān)系,綜合應(yīng)用從而服務(wù)于精準(zhǔn)診療。 去年奧巴馬提出了精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)計(jì)劃,并且準(zhǔn)備投資。2個(gè)億的投資雖不算巨大,但它將帶來的效益是很大的。對(duì)此,我國(guó)也積極跟進(jìn), 2015年初科技部就召開了相關(guān)的專家精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)戰(zhàn)略會(huì)議來討論我們國(guó)內(nèi)的精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)問題。 奧巴馬所提出的精準(zhǔn)醫(yī)療的觀念實(shí)際上還是比較狹義的,通俗來說,相較于原先的標(biāo)準(zhǔn)治療方案的制定,精準(zhǔn)醫(yī)療需要考慮到個(gè)體性的差異,而個(gè)體性的差異里既包含了遺傳性的差異,也包含了生活環(huán)境等的差異。廣義上的精準(zhǔn)醫(yī)療是應(yīng)用現(xiàn)代遺傳技術(shù)、分子影像技術(shù)、生物信息技術(shù),結(jié)合患者生活環(huán)境和臨床數(shù)據(jù),實(shí)現(xiàn)精準(zhǔn)的疾病分類和診斷,制定具有個(gè)性化的疾病預(yù)防和診療方案,其中包含了風(fēng)險(xiǎn)精準(zhǔn)預(yù)測(cè)、疾病精確診斷、疾病精確分類、藥物精確應(yīng)用、療效精確評(píng)估等內(nèi)容。因此,精準(zhǔn)醫(yī)療是一個(gè)全覆蓋的范疇很廣的概念。 如果我們能夠做早期的風(fēng)險(xiǎn)評(píng)估和檢測(cè),就可以做一些干預(yù)措施或者預(yù)防性的治療,不但可以避免疾病的發(fā)生,還能大大降低醫(yī)療成本。這也正是精準(zhǔn)醫(yī)療幫助我們提高生存率和降低醫(yī)療成本的關(guān)鍵內(nèi)容。 腫瘤的精準(zhǔn)治療之所以很難,關(guān)鍵就在于它的異質(zhì)性。腫瘤細(xì)胞可以是各種細(xì)胞,且所處的微環(huán)境都可以不一樣,這其中既包含腫瘤之間外部形態(tài)的不同,也包含腫瘤內(nèi)部組織結(jié)構(gòu)的不同,還有增強(qiáng)特性的不同。這就意味著在診療過程中,要充分考慮到腫瘤的差異性或異質(zhì)性,否則可能造成錯(cuò)誤治療。 影像基因組學(xué)應(yīng)用于腫瘤的精準(zhǔn)治療 臨床上兩大類信息可以用于腫瘤的精準(zhǔn)治療,一個(gè)是基因組學(xué),一個(gè)是影像學(xué)。 基因組信息的優(yōu)勢(shì)在于它的個(gè)體性差異較好,但是成本相對(duì)較高,在腫瘤表觀變化和內(nèi)部變化上有局限性。而影像學(xué)信息有很好的重復(fù)性,但是特異性相對(duì)較差,與基因組學(xué)有互補(bǔ)性。因此我們是否能把影像學(xué)和基因組學(xué)的東西建立起聯(lián)系,然后進(jìn)行綜合應(yīng)用,是影像基因組學(xué)需要解決的問題。 那么什么是影像基因組學(xué)呢? 影像基因組學(xué)要建立的是疾病的影像學(xué)特征與其基因表現(xiàn)型、基因突變和包括個(gè)體基因表達(dá)和特殊基因亞型表達(dá)檢測(cè)在內(nèi)的基因組相關(guān)特征之間的關(guān)系。 那么為什么要用影像基因組學(xué)呢? 實(shí)際上腫瘤并不是同質(zhì)性器官,相反的,它們包含了由演變性癌癥、基質(zhì)和免疫細(xì)胞群組成的生態(tài)社區(qū)聯(lián)盟。無論是在基因組還是表觀意義上,腫瘤都呈現(xiàn)了高度的異質(zhì)性,對(duì)治療的影響很大。而隨著定量影像技術(shù)發(fā)展得越來越好,它不僅只是可以做定性的判斷,還可以做空間性的定量描述,不論是結(jié)構(gòu)、功能還是生物化學(xué)信息,從而來反映代謝、凋亡等很多的情況。 影像基因組學(xué)在不同的領(lǐng)域有不同的形式,比如影像遺傳學(xué)(Imaging Gengetics)、影像基因組學(xué)(Imaging Genome)和影像組學(xué)(Radiomics)等。通過定量化的東西,希望可以將更多的疾病特征更加有效地描述出來。 比如我們?cè)谧瞿[瘤評(píng)價(jià)的時(shí)候,傳統(tǒng)方法是測(cè)量直徑等二維方法,而現(xiàn)在隨著技術(shù)的發(fā)展,我們可以進(jìn)一步細(xì)化分析內(nèi)部結(jié)構(gòu)。這一塊應(yīng)該是未來的發(fā)展方向,因?yàn)槟[瘤不僅僅是遺傳問題,也可能是環(huán)境問題。 在治療上,我們也做了兩者綜合應(yīng)用的研究,發(fā)現(xiàn)了很多的價(jià)值。比如有研究提取了6000多個(gè)基因中的100多個(gè)基因的表現(xiàn)型,與100多個(gè)影像結(jié)果進(jìn)行比較來理解兩者之間的關(guān)系,發(fā)現(xiàn)腫瘤的異質(zhì)性與細(xì)胞循環(huán)通路是有很強(qiáng)的關(guān)系的。 腫瘤的異質(zhì)性是精準(zhǔn)治療中的一個(gè)很大的障礙,我們的挑戰(zhàn)是如何應(yīng)用信息手段去解決,隨著影像技術(shù)的發(fā)展,我們可以很好地了解疾病的生物信息。新影像技術(shù)和基因組有關(guān)聯(lián),并且在一定的情況下關(guān)聯(lián)很強(qiáng),關(guān)鍵在于我們?nèi)绾稳ネ诰?。因此,影像基因組學(xué)的研究將有助于精準(zhǔn)醫(yī)療研究的推進(jìn)。 本文根據(jù)2016西湖論健國(guó)際高峰論壇上嘉賓演講內(nèi)容整理而成,已與嘉賓確認(rèn),個(gè)中觀點(diǎn)不代表火石立 |
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