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Python數(shù)據(jù)分析之pandas學(xué)習(xí)(一)

 無聊齋話 2016-08-20

1、數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)簡介:DataFrame和Series

2、數(shù)據(jù)索引index

3、利用pandas查詢數(shù)據(jù)

4、利用pandas的DataFrames進(jìn)行統(tǒng)計分析

5、利用pandas實現(xiàn)SQL操作

6、利用pandas進(jìn)行缺失值的處理

7、利用pandas實現(xiàn)Excel的數(shù)據(jù)透視表功能

8、多層索引的使用


一、數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)介紹

在pandas中有兩類非常重要的數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu),即序列Series和數(shù)據(jù)框DataFrame。Series類似于numpy中的一維數(shù)組,除了通吃一維數(shù)組可用的函數(shù)或方法,而且其可通過索引標(biāo)簽的方式獲取數(shù)據(jù),還具有索引的自動對齊功能;DataFrame類似于numpy中的二維數(shù)組,同樣可以通用numpy數(shù)組的函數(shù)和方法,而且還具有其他靈活應(yīng)用,后續(xù)會介紹到。

1、Series的創(chuàng)建

序列的創(chuàng)建主要有三種方式:

1)通過一維數(shù)組創(chuàng)建序列

In [1]: import numpy as np, pandas as pd

In [2]: arr1 = np.arange(10)

In [3]: arr1

Out[3]: array([0, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9])

In [4]: type(arr1)

Out[4]: numpy.ndarray

返回的是數(shù)組類型。


In [5]: s1 = pd.Series(arr1)

In [6]: s1

Out[6]:

0    0

1    1

2    2

3    3

4    4

5    5

6    6

7    7

8    8

9    9

dtype: int32

In [7]: type(s1)

Out[7]: pandas.core.series.Series

返回的是序列類型。


2)通過字典的方式創(chuàng)建序列

In [8]: dic1 = {'a':10,'b':20,'c':30,'d':40,'e':50}

In [9]: dic1

Out[9]: {'a': 10, 'b': 20, 'c': 30, 'd': 40, 'e': 50}

In [10]: type(dic1)

Out[10]: dict

返回的是字典類型。


In [11]: s2 = pd.Series(dic1)

In [12]: s2

Out[12]:

a    10

b    20

c    30

d    40

e    50

dtype: int64

In [13]: type(s2)

Out[13]: pandas.core.series.Series

返回的是序列類型。


3)通過DataFrame中的某一行或某一列創(chuàng)建序列

這部分內(nèi)容我們放在后面講,接下來就開始講一講如何構(gòu)造一個DataFrame。


2、DataFrame的創(chuàng)建

數(shù)據(jù)框的創(chuàng)建主要有三種方式:

1)通過二維數(shù)組創(chuàng)建數(shù)據(jù)框

In [14]: arr2 = np.array(np.arange(12)).reshape(4,3)

In [15]: arr2

Out[15]:

array([[ 0,  1,  2],

[ 3,  4,  5],

[ 6,  7,  8],

[ 9, 10, 11]])

In [16]: type(arr2)

Out[16]: numpy.ndarray

返回的是數(shù)組類型。


In [17]: df1 = pd.DataFrame(arr2)

In [18]: df1

Out[18]:

0   1   2

0  0   1   2

1  3   4   5

2  6   7   8

3  9  10  11

In [19]: type(df1)

Out[19]: pandas.core.frame.DataFrame

返回的數(shù)據(jù)框類型。


2)通過字典的方式創(chuàng)建數(shù)據(jù)框

以下以兩種字典來創(chuàng)建數(shù)據(jù)框,一個是字典列表,一個是嵌套字典。

In [20]: dic2 = {'a':[1,2,3,4],'b':[5,6,7,8],

    ...:         'c':[9,10,11,12],'d':[13,14,15,16]}

In [21]: dic2

Out[21]:

{'a': [1, 2, 3, 4],

'b': [5, 6, 7, 8],

'c': [9, 10, 11, 12],

'd': [13, 14, 15, 16]}

In [22]: type(dic2)

Out[22]: dict

返回的是字典類型。


In [23]: df2 = pd.DataFrame(dic2)

In [24]: df2

Out[24]:

a  b   c   d

0  1  5   9  13

1  2  6  10  14

2  3  7  11  15

3  4  8  12  16

In [25]: type(df2)

Out[25]: pandas.core.frame.DataFrame

返回的是數(shù)據(jù)框類型。


In [26]: dic3 = {'one':{'a':1,'b':2,'c':3,'d':4},

    ...:         'two':{'a':5,'b':6,'c':7,'d':8},

    ...:         'three':{'a':9,'b':10,'c':11,'d':12}}

In [27]: dic3

Out[27]:

{'one': {'a': 1, 'b': 2, 'c': 3, 'd': 4},

'three': {'a': 9, 'b': 10, 'c': 11, 'd': 12},

'two': {'a': 5, 'b': 6, 'c': 7, 'd': 8}}

In [28]: type(dic3)

Out[28]: dict

返回的是字典類型。


In [29]: df3 = pd.DataFrame(dic3)

In [30]: df3

Out[30]:

one  three  two

a    1      9    5

b    2     10    6

c    3     11    7

d    4     12    8

In [31]: type(df3)

Out[31]: pandas.core.frame.DataFrame

返回的是數(shù)據(jù)框類型。這里需要說明的是,如果使用嵌套字典創(chuàng)建數(shù)據(jù)框的話,嵌套字典的最外層鍵會形成數(shù)據(jù)框的列變量,而內(nèi)層鍵則會形成數(shù)據(jù)框的行索引。


3)通過數(shù)據(jù)框的方式創(chuàng)建數(shù)據(jù)框

In [32]: df4 = df3[['one','three']]

In [33]: df4

Out[33]:

one  three

a    1      9

b    2     10

c    3     11

d    4     12

In [34]: type(df4)

Out[34]: pandas.core.frame.DataFrame

返回的是數(shù)據(jù)框類型。


In [35]: s3 = df3['one']

In [36]: s3

Out[36]:

a    1

b    2

c    3

d    4

Name: one, dtype: int64

In [37]: type(s3)

Out[37]: pandas.core.series.Series

這里就是通過選擇數(shù)據(jù)框中的某一列,返回一個序列的對象。


二、數(shù)據(jù)索引index

細(xì)致的朋友可能會發(fā)現(xiàn)一個現(xiàn)象,不論是序列也好,還是數(shù)據(jù)框也好,對象的最左邊總有一個非原始數(shù)據(jù)對象,這個是什么呢?不錯,就是我們接下來要介紹的索引。

在我看來,序列或數(shù)據(jù)框的索引有兩大用處,一個是通過索引值或索引標(biāo)簽獲取目標(biāo)數(shù)據(jù),另一個是通過索引,可以使序列或數(shù)據(jù)框的計算、操作實現(xiàn)自動化對齊,下面我們就來看看這兩個功能的應(yīng)用。

1、通過索引值或索引標(biāo)簽獲取數(shù)據(jù)

In [38]: s4 = pd.Series(np.array([1,1,2,3,5,8]))

In [39]: s4

Out[39]:

0    1

1    1

2    2

3    3

4    5

5    8

dtype: int32

如果不給序列一個指定的索引值,則序列自動生成一個從0開始的自增索引??梢酝ㄟ^index查看序列的索引:

In [40]: s4.index

Out[40]: RangeIndex(start=0, stop=6, step=1)

現(xiàn)在我們?yōu)樾蛄性O(shè)定一個自定義的索引值:

In [41]: s4.index = ['a','b','c','d','e','f']

In [42]: s4

Out[42]:

a    1

b    1

c    2

d    3

e    5

f    8

dtype: int32

序列有了索引,就可以通過索引值或索引標(biāo)簽進(jìn)行數(shù)據(jù)的獲?。?/p>

In [43]: s4[3]

Out[43]: 3

In [44]: s4['e']

Out[44]: 5

In [45]: s4[[1,3,5]]

Out[45]:

b    1

d    3

f    8

dtype: int32

In [46]: s4[['a','b','d','f']]

Out[46]:

a    1

b    1

d    3

f    8

dtype: int32

In [47]: s4[:4]

Out[47]:

a    1

b    1

c    2

d    3

dtype: int32

In [48]: s4['c':]

Out[48]:

c    2

d    3

e    5

f    8

dtype: int32

In [49]: s4['b':'e']

Out[49]:

b    1

c    2

d    3

e    5

dtype: int32

千萬注意:如果通過索引標(biāo)簽獲取數(shù)據(jù)的話,末端標(biāo)簽所對應(yīng)的值是可以返回的!在一維數(shù)組中,就無法通過索引標(biāo)簽獲取數(shù)據(jù),這也是序列不同于一維數(shù)組的一個方面。


2、自動化對齊

如果有兩個序列,需要對這兩個序列進(jìn)行算術(shù)運(yùn)算,這時索引的存在就體現(xiàn)的它的價值了--自動化對齊。

In [50]: s5 = pd.Series(np.array([10,15,20,30,55,80]),

    ...:                index = ['a','b','c','d','e','f'])

In [51]: s5

Out[51]:

a    10

b    15

c    20

d    30

e    55

f    80

dtype: int32


In [52]: s6 = pd.Series(np.array([12,11,13,15,14,16]),

    ...:                index = ['a','c','g','b','d','f'])

In [53]: s6

Out[53]:

a    12

c    11

g    13

b    15

d    14

f    16

dtype: int32


In [54]: s5 + s6

Out[54]:

a    22.0

b    30.0

c    31.0

d    44.0

e     NaN

f    96.0

g     NaN

dtype: float64


In [55]: s5/s6

Out[55]:

a    0.833333

b    1.000000

c    1.818182

d    2.142857

e         NaN

f    5.000000

g         NaN

dtype: float64

由于s5中沒有對應(yīng)的g索引,s6中沒有對應(yīng)的e索引,所以數(shù)據(jù)的運(yùn)算會產(chǎn)生兩個缺失值NaN。注意,這里的算術(shù)結(jié)果就實現(xiàn)了兩個序列索引的自動對齊,而非簡單的將兩個序列加總或相除。對于數(shù)據(jù)框的對齊,不僅僅是行索引的自動對齊,同時也會自動對齊列索引(變量名)。


數(shù)據(jù)框中同樣有索引,而且數(shù)據(jù)框是二維數(shù)組的推廣,所以數(shù)據(jù)框不僅有行索引,而且還存在列索引,關(guān)于數(shù)據(jù)框中的索引相比于序列的應(yīng)用要強(qiáng)大的多,這部分內(nèi)容將放在下面的數(shù)據(jù)查詢中講解。


三、利用pandas查詢數(shù)據(jù)

這里的查詢數(shù)據(jù)相當(dāng)于R語言里的subset功能,可以通過布爾索引有針對的選取原數(shù)據(jù)的子集、指定行、指定列等。我們先導(dǎo)入一個student數(shù)據(jù)集:

In [56]: student = pd.io.parsers.read_csv('C:\\Users\\admin\\Desktop\\student.csv')

查詢數(shù)據(jù)的前5行或末尾5行:

In [57]: student.head()

Out[57]:

Name Sex  Age  Height  Weight

0   Alfred   M   14    69.0   112.5

1    Alice   F   13    56.5    84.0

2  Barbara   F   13    65.3    98.0

3    Carol   F   14    62.8   102.5

4    Henry   M   14    63.5   102.5


In [58]: student.tail()

Out[58]:

Name Sex  Age  Height  Weight

14   Philip   M   16    72.0   150.0

15   Robert   M   12    64.8   128.0

16   Ronald   M   15    67.0   133.0

17   Thomas   M   11    57.5    85.0

18  William   M   15    66.5   112.0


查詢指定的行:

In [59]: student.ix[[0,2,4,5,7]] #這里的ix索引標(biāo)簽函數(shù)必須是中括號[]

Out[59]:

Name Sex  Age  Height  Weight

0   Alfred   M   14    69.0   112.5

2  Barbara   F   13    65.3    98.0

4    Henry   M   14    63.5   102.5

5    James   M   12    57.3    83.0

7    Janet   F   15    62.5   112.5


查詢指定的列:

In [60]: student[['Name','Height','Weight']].head()  #如果多個列的話,必須使用雙重中括號

Out[60]:

Name  Height  Weight

0   Alfred    69.0   112.5

1    Alice    56.5    84.0

2  Barbara    65.3    98.0

3    Carol    62.8   102.5

4    Henry    63.5   102.5


也可以通過ix索引標(biāo)簽查詢指定的列:

In [61]: student.ix[:,['Name','Height','Weight']].head()

Out[61]:

Name  Height  Weight

0   Alfred    69.0   112.5

1    Alice    56.5    84.0

2  Barbara    65.3    98.0

3    Carol    62.8   102.5

4    Henry    63.5   102.5


查詢指定的行和列:

In [62]: student.ix[[0,2,4,5,7],['Name','Height','Weight']].head()

Out[62]:

Name  Height  Weight

0   Alfred    69.0   112.5

2  Barbara    65.3    98.0

4    Henry    63.5   102.5

5    James    57.3    83.0

7    Janet    62.5   112.5


這里簡單說明一下ix的用法df.ix[行索引,列索引]

1)ix后面必須是中括號

2)多個行索引或列索引必須用中括號括起來

3)如果選擇所有行索引或列索引,則用英文狀態(tài)下的冒號:表示


以上是從行或列的角度查詢數(shù)據(jù)的子集,現(xiàn)在我們來看看如何通過布爾索引實現(xiàn)數(shù)據(jù)的子集查詢。

查詢所有女生的信息:

In [63]: student[student['Sex']=='F']

Out[63]:

Name Sex  Age  Height  Weight

1     Alice   F   13    56.5    84.0

2   Barbara   F   13    65.3    98.0

3     Carol   F   14    62.8   102.5

6      Jane   F   12    59.8    84.5

7     Janet   F   15    62.5   112.5

10    Joyce   F   11    51.3    50.5

11     Judy   F   14    64.3    90.0

12   Louise   F   12    56.3    77.0

13     Mary   F   15    66.5   112.0


查詢出所有12歲以上的女生信息:

In [64]: student[(student['Sex']=='F') & (student['Age']>12)]

Out[64]:

Name Sex  Age  Height  Weight

1     Alice   F   13    56.5    84.0

2   Barbara   F   13    65.3    98.0

3     Carol   F   14    62.8   102.5

7     Janet   F   15    62.5   112.5

11     Judy   F   14    64.3    90.0

13     Mary   F   15    66.5   112.0


查詢出所有12歲以上的女生姓名、身高和體重:

In [66]: student[(student['Sex']=='F') & (student['Age']>12)][['Name','Height','Weight']]

Out[66]:

Name  Height  Weight

1     Alice    56.5    84.0

2   Barbara    65.3    98.0

3     Carol    62.8   102.5

7     Janet    62.5   112.5

11     Judy    64.3    90.0

13     Mary    66.5   112.0

上面的查詢邏輯其實非常的簡單,需要注意的是,如果是多個條件的查詢,必須在&(且)或者|(或)的兩端條件用括號括起來。


四、統(tǒng)計分析

pandas模塊為我們提供了非常多的描述性統(tǒng)計分析的指標(biāo)函數(shù),如總和、均值、最小值、最大值等,我們來具體看看這些函數(shù):

首先隨機(jī)生成三組數(shù)據(jù)

In [67]: np.random.seed(1234)

In [68]: d1 = pd.Series(2*np.random.normal(size = 100)+3)

In [69]: d2 = np.random.f(2,4,size = 100)

In [70]: d3 = np.random.randint(1,100,size = 100)


In [71]: d1.count()  #非空元素計算

Out[71]: 100

In [72]: d1.min()    #最小值

Out[72]: -4.1270333212494705

In [73]: d1.max()    #最大值

Out[73]: 7.7819210309260658

In [74]: d1.idxmin() #最小值的位置,類似于R中的which.min函數(shù)

Out[74]: 81

In [75]: d1.idxmax() #最大值的位置,類似于R中的which.max函數(shù)

Out[75]: 39

In [76]: d1.quantile(0.1)    #10%分位數(shù)

Out[76]: 0.68701846440699277

In [77]: d1.sum()    #求和

Out[77]: 307.0224566250874

In [78]: d1.mean()   #均值

Out[78]: 3.070224566250874

In [79]: d1.median() #中位數(shù)

Out[79]: 3.204555266776845

In [80]: d1.mode()   #眾數(shù)

Out[80]: Series([], dtype: float64)

In [81]: d1.var()    #方差

Out[81]: 4.005609378535085

In [82]: d1.std()    #標(biāo)準(zhǔn)差

Out[82]: 2.0014018533355777

In [83]: d1.mad()    #平均絕對偏差

Out[83]: 1.5112880411556109

In [84]: d1.skew()   #偏度

Out[84]: -0.64947807604842933

In [85]: d1.kurt()   #峰度

Out[85]: 1.2201094052398012

In [86]: d1.describe()   #一次性輸出多個描述性統(tǒng)計指標(biāo)

Out[86]:

count    100.000000

mean       3.070225

std        2.001402

min       -4.127033

25%        2.040101

50%        3.204555

75%        4.434788

max        7.781921

dtype: float64

必須注意的是,describe方法只能針對序列或數(shù)據(jù)框,一維數(shù)組是沒有這個方法的。


這里自定義一個函數(shù),將這些統(tǒng)計描述指標(biāo)全部匯總到一起:

In [87]: def stats(x):

    ...:     return pd.Series([x.count(),x.min(),x.idxmin(),

    ...:                x.quantile(.25),x.median(),

    ...:                x.quantile(.75),x.mean(),

    ...:                x.max(),x.idxmax(),

    ...:                x.mad(),x.var(),

    ...:                x.std(),x.skew(),x.kurt()],

    ...:               index = ['Count','Min','Whicn_Min',

    ...:                        'Q1','Median','Q3','Mean',

    ...:                        'Max','Which_Max','Mad',

    ...:                        'Var','Std','Skew','Kurt'])


In [88]: stats(d1)

Out[88]:

Count        100.000000

Min           -4.127033

Whicn_Min     81.000000

Q1             2.040101

Median         3.204555

Q3             4.434788

Mean           3.070225

Max            7.781921

Which_Max     39.000000

Mad            1.511288

Var            4.005609

Std            2.001402

Skew          -0.649478

Kurt           1.220109

dtype: float64


在實際的工作中,我們可能需要處理的是一系列的數(shù)值型數(shù)據(jù)框,如何將這個函數(shù)應(yīng)用到數(shù)據(jù)框中的每一列呢?可以使用apply函數(shù),這個非常類似于R中的apply的應(yīng)用方法。

將之前創(chuàng)建的d1,d2,d3數(shù)據(jù)構(gòu)建數(shù)據(jù)框:

In [89]: df = pd.DataFrame(np.array([d1,d2,d3]).T,columns=['x1','x2','x3'])

In [90]: df.head()

Out[90]:

x1        x2    x3

0  3.942870  1.369531  55.0

1  0.618049  0.943264  68.0

2  5.865414  0.590663  73.0

3  2.374696  0.206548  59.0

4  1.558823  0.223204  60.0


In [91]: df.apply(stats)

Out[91]:

x1          x2          x3

Count      100.000000  100.000000  100.000000

Min         -4.127033    0.014330    3.000000

Whicn_Min   81.000000   72.000000   76.000000

Q1           2.040101    0.249580   25.000000

Median       3.204555    1.000613   54.500000

Q3           4.434788    2.101581   73.000000

Mean         3.070225    2.028608   51.490000

Max          7.781921   18.791565   98.000000

Which_Max   39.000000   53.000000   96.000000

Mad          1.511288    1.922669   24.010800

Var          4.005609   10.206447  780.090808

Std          2.001402    3.194753   27.930106

Skew        -0.649478    3.326246   -0.118917

Kurt         1.220109   12.636286   -1.211579


非常完美,就這樣很簡單的創(chuàng)建了數(shù)值型數(shù)據(jù)的統(tǒng)計性描述。如果是離散型數(shù)據(jù)呢?就不能用這個統(tǒng)計口徑了,我們需要統(tǒng)計離散變量的觀測數(shù)、唯一值個數(shù)、眾數(shù)水平及個數(shù)。你只需要使用describe方法就可以實現(xiàn)這樣的統(tǒng)計了。

In [92]: student['Sex'].describe()

Out[92]:

count     19

unique     2

top        M

freq      10

Name: Sex, dtype: object


除以上的簡單描述性統(tǒng)計之外,還提供了連續(xù)變量的相關(guān)系數(shù)(corr)和協(xié)方差矩陣(cov)的求解,這個跟R語言是一致的用法。

In [93]: df.corr()

Out[93]:

x1        x2        x3

x1  1.000000  0.136085  0.037185

x2  0.136085  1.000000 -0.005688

x3  0.037185 -0.005688  1.000000

關(guān)于相關(guān)系數(shù)的計算可以調(diào)用pearson方法或kendell方法或spearman方法,默認(rèn)使用pearson方法。

In [94]: df.corr('spearman')

Out[94]:

x1        x2        x3

x1  1.00000  0.178950  0.006590

x2  0.17895  1.000000 -0.033874

x3  0.00659 -0.033874  1.000000

如果只想關(guān)注某一個變量與其余變量的相關(guān)系數(shù)的話,可以使用corrwith,如下方只關(guān)心x1與其余變量的相關(guān)系數(shù):

In [95]: df.corrwith(df['x1'])

Out[95]:

x1    1.000000

x2    0.136085

x3    0.037185

dtype: float64


數(shù)值型數(shù)據(jù)的協(xié)方差矩陣:

In [96]: df.cov()

Out[96]:

x1         x2          x3

x1  4.005609   0.870124    2.078596

x2  0.870124  10.206447   -0.507512

x3  2.078596  -0.507512  780.090808



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由于正文部分不能超過20000字符,接下來的部分將在《Python數(shù)據(jù)分析之pandas學(xué)習(xí)(二)》中繼續(xù)講解。

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