我做 western 的時候,發(fā)現(xiàn)目前的資料都很老,網(wǎng)上的資料也大多互相傳抄,說法各異,于是綜合了目前網(wǎng)上所能找到的資料和個人實際經(jīng)驗,編輯了這份 western blot 操作步驟,內(nèi)容包括主要操作步驟和所需要注意的有用的細節(jié),并附上參考文獻。 我按下文的步驟操作已經(jīng)做出來了穩(wěn)定可重復的、背景干凈的 western 條帶了,所以相信你也行。為了節(jié)省時間,我總結(jié)了一下 western blot Quick Guide和一天做出 western 的具體時間規(guī)劃,附在文末,要在下一次展示。 蛋白質(zhì)印跡的發(fā)明者是斯坦福大學 George Stark。Neal Burnette 于 1981 年所著的 Analytical Biochemistry 中首次被稱為 Western Blot。最開始做印跡的是一個叫 Southern 的科學家,但印跡的對象是 DNA 鏈,他把這種技術(shù)稱為 Southern blot,后來出現(xiàn)了兩個過程相似,但是對象不同的印跡方法,一個針對RNA,一個對蛋白質(zhì),人們分別把這兩種技術(shù)的稱為 Northern 和 Western,與這兩個技術(shù)的發(fā)明人沒有關(guān)系了。 由于這一步方法各異,具體步驟請參考試劑盒的說明書即可。蛋白質(zhì)的樣品制備是 Western Blotting 的第一步,樣品制備是關(guān)鍵步驟,要求盡可能的獲得所有蛋白質(zhì),應(yīng)注意以下問題: 在合適的鹽濃度下,應(yīng)保持蛋白質(zhì)的最大溶解性和可重復性。 選擇合適的表面活性劑和還原劑,破壞所有非共價結(jié)合的蛋白質(zhì)復合物和共價鍵二硫鍵,使其形成一個各自多肽的溶液。盡量去除核酸,多糖,脂類等干擾分子。 防止蛋白質(zhì)在樣品處理過程中的人為的修飾,制備過程應(yīng)在低溫下進行,以避免細胞破碎釋放出的各種酶類的修飾(加入合適的蛋白酶抑制劑)。 樣品建議分裝成合適的量(比如分裝出 20 ul 檢測蛋白質(zhì)定量用),然后于 -20℃ 或 -80℃ 中長期保存,但要注意不要反復凍融,因為會使蛋白的抗原特性發(fā)生改變。 若蛋白提取過程存在問題或蛋白發(fā)生降解則很難進行好之后的實驗,也就很難做出好的結(jié)果了。除此之外 loading buffer 的作用也不容忽視,切莫使用不新鮮的上樣緩沖液,同時在處理時也應(yīng)注意將樣品與 loading buffer 混合均勻。 如果要定量的話,一般選擇 BCA 或者 Bradford 方法,BCA 要求檢測波長為 562 nm,Bradford 為 595 nm。具體方法見各試劑盒說明書。為避免假陽性結(jié)果,建議先把 lysis buffer 加入 BCA 工作液或考馬 G250 混合看是否產(chǎn)生顏色。測完蛋白含量后,計算含 50~100 ug 蛋白的溶液體積即為上樣量(一般 8 cm 寬的迷你膠每個泳道最大能承載的蛋白質(zhì)量為 150 ug,所以如果從組織提取蛋白的話上樣量不宜過大)。 網(wǎng)上有人喜歡等質(zhì)量上樣(即每個泳道的上樣體積不一但質(zhì)量一定),也有使用等體積上樣(即先把各個樣品稀釋到某一固定濃度,然后等體積等質(zhì)量上樣,計算上樣體積時需包含 loading buffer 的體積)。按分子克隆的說法,還是使用等體積上樣比較好。 上樣總體積一般不超過 15 ul,加樣孔的最大限度可加 20 ul 樣品。上樣前要將樣品置于燒杯內(nèi),將燒杯置于石棉網(wǎng)上用酒精燈加熱至沸騰,在沸水中煮 3~5 min 使蛋白充分變性。也可以使用 PCR 儀 95°加熱 5 min,效果佳,操作方便。之后樣品可以在 4℃ 冰箱短時間保存,也可在 -20℃ 冰箱保存數(shù)月,但是反復凍融會使蛋白質(zhì)的抗原特性改變。
今天就講到這兒,欲知后事如何,且聽下回分解。 文章來源:丁香園站友 @dlzhangyu |
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