最近經(jīng)常出現(xiàn)一個(gè)錯(cuò)誤，類似于package ‘a(chǎn)irway’ is not available (for R version 3.1.0)

就是某些包在R的倉(cāng)庫(kù)里面找不到，這個(gè)錯(cuò)誤非常普遍，stackoverflow上面非常詳細(xì)的解答：

http:///questions/25721884/how-should-i-deal-with-package-xxx-is-not-available-for-r-version-x-y-z-wa

在閱讀這個(gè)答案的時(shí)候，我發(fā)現(xiàn)了一個(gè)非常有用的函數(shù)！available.packages()可以查看自己的機(jī)器可以安裝哪些包！

R語言里面的包其實(shí)是很簡(jiǎn)單的，因?yàn)樗詭Я艘粋€(gè)安裝函數(shù)install.packages()基本上可以解決大部分問題！

但是如果出問題也是蠻復(fù)雜的，因?yàn)橐紤]的東西很多:

• 首先你的R語言安裝在什么機(jī)器什么？（linux(ubuntu?centos?),window,mac）
• 其次你的R是什么版本:(3.1 ? 3.2 ?  http://www./1307.html )
• 然后你的安裝器是什么版本？（主要針對(duì)于bioconductor包的安裝）
• 然后你的聯(lián)網(wǎng)方式是什么？https ？http ？
• 最后你選擇的R包鏡像是什么？

我們首先要知道自己的R包安裝到了什么地方?

> .libPaths()[1] 'C:/Users/jmzeng/Documents/R/win-library/3.1'[2] 'C:/Program Files/R/R-3.1.0/library'

這樣可以直接進(jìn)入這些目錄去看看有哪些包，每個(gè)包都會(huì)有一個(gè)文件夾！

其次你可以用installed.packages()查看你已經(jīng)安裝了哪些包

可以具體到你所安裝的包的16個(gè)信息?。。?/p>

最后你可以用available.packages()可以查看自己的機(jī)器可以安裝哪些包！

####

ap <->
> dim(ap)

[1] 7662   17

可以得到你現(xiàn)在所要能夠安裝的包??！得到的ap是一個(gè)矩陣[1] 7662   17 如下： 我們就很容易查看自己想安裝的包是否存在于正在使用的R的倉(cāng)庫(kù)里面！> grep('A3',rownames(ap))[1]    1 1685 2212> grep('ABCp2',rownames(ap))[1] 4> grep('airway',rownames(ap))integer(0)> 或者用'airway' %in% rownames(ap)

可以看出，我們想安裝的airway包根本不存在，當(dāng)然，這肯定是不存在的。因?yàn)閍irway是bioconductor的包，不是R的包??！

• > dim(available.packages(contriburl = “https://cran./bin/windows/contrib/3.2/“))
• [1] 8110   17
• > dim(ap)
• [1] 8155   17
• > dim(available.packages(contriburl = “http:///packages/3.1/bioc/bin/windows/contrib/3.2/“))
• [1] 1000   17
• > dim(available.packages(contriburl = “http://mirrors.ustc.edu.cn/bioc//packages/3.1/bioc/bin/windows/contrib/3.2/“))
• [1] 1000   17

用這個(gè)參數(shù)，可以看不同倉(cāng)庫(kù)，甚至不同版本的R包共有哪些資源！??！See also Names of R's available packages, ?available.packages.Alternatively, the list of available packages can be seen in a browser for CRAN, CRAN (extras), Bioconductor, R-forge and RForge.

本文固定鏈接: http://www./1537.html | 生信菜鳥團(tuán)